Ngày 04.05.1994 theo quyết định số 1316/QĐ-UB-QLĐT giao lại khu đất cho Dòng Mến Thánh Giá Chợ Quán. Các nữ tu đã hình thành một Nhóm giữ trẻ, để chăm sóc, nuôi dạy các cháu con của anh chị em công nhân trong khu vực để phụ huynh đi làm việc.
Nhóm trẻ do nữ tu Ngô Thị Luyến làm chủ nhiệm. Từ con số 20 đến 40 cháu và phát triển dần đến 100 cháu.
Ngày 12.02.2003 Ủy Ban Nhân Dân Quận Thủ Đức, theo đơn xin của Nhóm trẻ, đã ban hành Quyết định số 39/QĐ-UB thành lập trường Mầm Non Tư Thục Hoa Phượng tại số 30/1 khu phố 4 (nay là số 58 đường số 5). Phường Linh Xuân, quận Thủ Đức. Với số trẻ trên 250 cháu. Hiệu trưởng là nữ tu Trương Thị Thu Hương.
Năm 2006, theo sự phát triển và nhu cầu của địa phương, nhà dòng Mến Thánh Giá Chợ Quán đã hỗ trợ cho nhà trường xây dựng mới cơ sở với quy mô hiện có. Số học sinh tăng từ 250 đến 450 cháu. Với sự cố gắng hoàn thiện đội ngũ, cách thức tổ chức và phương pháp giảng dạy, nhất là lòng yêu nghề mến trẻ của tập thể Giáo viên Nhân viên trường, phòng Giáo Dục Quận Thủ Đức đã mạnh dạn đề bạc và giúp nhà trường xây dựng Chuẩn Quốc Gia.
Năm 2010, theo Quyết định trường được Sở Giáo Dục Thành phổ Hổ Chí Minh công nhận đạt Chuẩn Quốc Gia mức độ 1.
Cho đến nay, nhà trường vẫn cố gắng duy trì thành quả và cải tiến, cập nhật các phương tiện hiện đại để chăm sóc gíao dục cháu. Tuy số lượng cháu có giảm do di dân nhưng tập thể nhà trường vẫn giữ vững chất lượng và nhiệt tình trong công tác chăm sóc giáo dục trẻ Mầm Non.